Schița de curs
I. Introducere și preliminarii
1. Prezentare generală
- Faceți R mai prietenos, R și GUI-uri disponibile Rstudio Software și documentație înrudite R și statistici Utilizarea interactivă a R O sesiune introductivă Obținerea de ajutor cu funcții și caracteristici Comenzi R, diferențiere între majuscule și minuscule, etc. un fișier Permanența datelor și eliminarea obiectelor Good practica de programare: scripturi autonome, lizibilitate bună de exemplu scripturi structurate, documentație, pachete de instalare cu reducere; CRAN și Bioconductor
2. Citirea datelor
- Fișiere Txt (read.delim) Fișiere CSV
3. Manipulari simple; numere și vectori + tablouri
- Vectori și atribuire Aritmetică vectorială Generarea de secvențe regulate Vectori logici Valori lipsă Vectori de caractere Vectori index; selectarea și modificarea subseturilor unui set de date Arrays
Liste Construirea și modificarea listelor Concatenarea listelor
- Cadre de date Realizarea de cadre de date
6. Mai multe despre Citirea datelor
- Cititor de fișiere XLS, XLSX și pachete readxl SPSS, SAS, Stata,... și alte formate de date Exportarea datelor în txt, csv și alte formate
6. Grupare, bucle și execuție condiționată
- Expresii grupate Instrucțiuni de control Execuție condiționată: instrucțiuni if Execuție repetitivă: pentru bucle, repetare și while intro în apply, lapply, sapply, tapply
7. Funcții
- Crearea funcțiilor Argumente opționale și valori implicite Număr variabil de argumente Domeniul de aplicare și consecințele acestuia
8. Grafică simplă în R
- Crearea unui grafic Diagrame de densitate Diagrame cu puncte Diagrame cu bare Diagrame cu linii Diagrame circulare Diagrame cu case Diagrame cu dispersie Combinarea graficelor
II. Analiza statistică în R
- 1. Distribuții de probabilitate
R ca set de tabele statistice Examinând distribuția unui set de date
2. Testarea ipotezelor
- Teste despre o populație Testul raportului de probabilitate medie al populației Teste cu unul și două eșantioane Testul Chi-pătrat GoTestul de potrivire Kolmogorov-Smirnov Statistică dintr-un singur eșantion Testul Wilcoxon cu rang semnat Testul cu două eșantioane Testul Wilcoxon Suma de rang Mann-Whitney Testul Kolmogorov-Smirnov Test
3. Testarea multiplă a ipotezelor
- Eroare de tip I și curbe FDR ROC și proceduri de testare multiple AUC (BH, Bonferroni etc.)
4. Modele de regresie liniară
- Funcții generice pentru extragerea informațiilor despre model Actualizarea modelelor montate Modele liniare generalizate Familii Funcția glm()
Clasificare Regresie logistică
- Analiza liniară discriminantă
III. Probleme lucrate în bioinformatică
- Scurtă introducere în pachetul limma Flux de lucru pentru analiza datelor microarray Descărcare de date din GEO: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1397 Procesarea datelor (QC, normalizare, expresie diferențială) Graficul vulcanului Exemple de custering + hărți termice
Mărturii (9)
The pace was just right and the relaxed atmosphere made candidates feel at ease to ask questions.
Rhian Hughes - Public Health Wales NHS Trust
Curs - Introduction to Data Visualization with Tidyverse and R
Conținutul, deoarece mi s-a părut foarte interesant și cred că m-ar ajuta în ultimul meu an de facultate.
Krishan - NBrown Group
Curs - From Data to Decision with Big Data and Predictive Analytics
Tradus de catre o masina
very tailored to needs
Yashan Wang
Curs - Data Mining with R
The trainer was so knowledgeable and included areas I was interested in
Mohamed Salama
Curs - Data Mining & Machine Learning with R
Good real world examples, reviews of existing reports
Ronald Parrish
Curs - Data Visualization
Intensity, Training materials and expertise, Clarity, Excellent communication with Alessandra
Marija Hornis Dmitrovic - Marija Hornis
Curs - Data Science for Big Data Analytics
I learned a lot - not only in theoretical knowledge but I also applied that knowledge during the training and therefore I really understood what process mining is and how it works. Thanks a lot!
Julia Dörre - Techniker Krankenkasse
Curs - Process Mining
how the trainor shows his knowledge in the subject he's teachign
john ernesto ii fernandez - Philippine AXA Life Insurance Corporation
Curs - Data Vault: Building a Scalable Data Warehouse
Acum mă simt mai încrezător în ceea ce privește codarea. Nu am mai făcut-o până acum, dar acum înțeleg că nu este o știință a rachetelor și că pot să o fac atunci când este necesar.
Anna - Birmingham City University
Curs - Foundation R
Tradus de catre o masina