Schița de curs

Introducere în limbajul de programare Python

  • De ce Python?
  • Utilizarea Python pentru prelucrarea datelor biologice
  • Lucrul cu iPython shell
  • Primul dvs. program
  • Scrierea scripturilor Python
  • Importul modulelor

Lucrul cu secvențe de proteine și ARN/ADN

  • Găsirea motivelor
  • Transcrierea și traducerea in silico
  • Gestionarea alinierilor de secvențe

Parsarea datelor în diferite formate biologice

  • Parsarea FASTA
  • Conversia formatelor de date

Efectuarea de analize biologice

  • BLAST
  • Accessing servicii web biologice

Tratarea structurilor biologice 3D utilizând Python

Python facilitează analiza statistică

Vizualizarea datelor

  • Crearea de diagrame de bare și de dispersie
  • Calcularea unei suprafețe sub curbă (AUC)

Lucrul cu fișiere .xls și .csv

  • Importul de date din și exportul către MS Excel / OpenOffice Calc
  • Scrierea fișierelor .xls și .csv

Utilizarea Python pentru crearea unei conducte automate de prelucrare a datelor

Cerințe

Cunoștințe biologice de bază despre secvențele de proteine, ARN și ADN.

 28 ore

Numărul de participanți


Pret per participant

Mărturii (1)

Upcoming Courses

Categorii înrudite