Schița de curs

Introducere în limbajul de programare Python

  • De ce Python?
  • Utilizarea Python pentru gestionarea datelor biologice
  • Lucrul cu shell-ul iPython
  • Primul tău program
  • Scrierea de scripturi Python
  • Importul de module

Lucrul cu secvențe de proteine și ARN/ADN

  • Găsirea motivelor
  • Transcriere și traducere in silico
  • Gestionarea alinierilor de secvențe

Parsarea datelor în diferite formate biologice

  • Parsarea FASTA
  • Conversia formatelor de date

Efectuarea de analize biologice

  • BLAST
  • Accesarea serviciilor web biologice

Gestionarea structurilor biologice 3D folosind Python

Python facilitează analiza statistică

Vizualizarea datelor

  • Crearea de grafice cu bare și scatter plots
  • Calcularea ariei sub curba (AUC)

Lucrul cu fișiere .xls și .csv

  • Importul datelor din și exportul către MS Excel / OpenOffice Calc
  • Scrierea fișierelor .xls și .csv

Utilizarea Python pentru crearea unei conducte automate de procesare a datelor

Cerințe

Cunoștințe de bază despre secvențele de proteine, ARN și ADN.

 28 Ore

Numărul de participanți


Pret per participant

Mărturii (1)

Cursuri viitoare

Categorii înrudite